Şablon:Protein ailesi bilgi kutusu/belge
 | Bu sayfa, Şablon:Protein ailesi bilgi kutusu sayfasının bir belgeleme alt sayfasıdır. Asıl şablon sayfası hakkında kullanım talimatları, kategoriler ve başka içerikleri barındırmaktadır. |
 | Bu şablon iki dilli kullanıma uygundur. Başka bir projede üretilen bu şablon, Türkçe Vikipedi'ye uyarlanması sırasında Türkçeleştirilmiş ancak özgün İngilizce parametreleri de korunmuştur. Bu nedenle hem İngilizce hem de Türkçe parametreler kullanılabilir. |
Bu şablon, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlandığı şekliyle bir protein ailesi/alanı için şablondur.
Kullanım
değiştirBu şablonu kullanmak için aşağıdaki metni kopyalayın ve maddenizin en üstüne yapıştırın. Mümkün olduğunca çok alanı doldurun, ancak bazı bilgiler eksikse endişelenmeyin.
{{Protein ailesi bilgi kutusu
| sınıf = <!-- yer kazanmak için: mw-collapsible mw-collapsed -->
| Sembol =
| Ad =
| resim =
| altyazı =
| Pfam =
| Pfam_clan =
| InterPro =
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM ailesi = <!-- aslında OPM süper ailesi. SADECE protein ailesi tam bir "süperaile" eşleşmesine sahip olduğunda yazın! -->
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome süperailesi = <!-- yukarıdakiyle aynı: yalnızca tam eşleşme olduğunda. -->
| Membranome ailesi =
}}
Örnekler
değiştirAşağıdaki doldurulmuş Pfam bilgi kutusu şablonu sağdaki bilgi kutusunu üretir.
| Ligand-binding domain (LBD) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Hormone_recep | |||||||||
| Pfam | PF00104 | ||||||||
| InterPro | IPR000536 | ||||||||
| SMART | SM00430 | ||||||||
| CATH | 1lbd | ||||||||
| SCOP2 | 1lbd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd06157 | ||||||||
| |||||||||
{{Protein ailesi bilgi kutusu
| Sembol = Hormone_recep
| sınıf = collapsible
| Ad = Ligand-binding domain (LBD)
| resim = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR ile ilişkili yetim reseptör gama|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE =
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM ailesi =
| OPM proteini =
| CDD = cd06157
}}
Bakım
değiştirTemplateData
değiştirProtein ailesi bilgi kutusu için şablon verileri
Bu, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlanan bir protein ailesi/alanı için şablondur.
| Parametre | Açıklama | Tür | Durum | |
|---|---|---|---|---|
| Sembol | Sembol | açıklama yok | Satır | isteğe bağlı |
| Ad | Ad | açıklama yok | Satır | isteğe bağlı |
| resim | resim | izleme kategorisini bastırmak için gerekli değilse "NONE" olarak doldurun | Dosya | isteğe bağlı |
| Genişlik | genişlik | Görüntü için genişlik | Dize | isteğe bağlı |
| Altyazı | altyazı | Resim için altyazı | Dize | isteğe bağlı |
| InterPro aile tanımlayıcısı | InterPro | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| Pfam aile tanımlayıcısı | Pfam | Pfam aile kaydına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| Pfam klanı tanımlayıcısı | Pfam_klanı | Pfam klan kaydına otomatik bağlantılar; bir klan, ilişkili ailelerden oluşan bir gruptur (~üst aile). | Satır | isteğe bağlı |
| Interpro tanımlayıcısı | Interpro | Interpro girişine otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| SMART erişim numarası | SMART | Basit Modüler Mimari Araştırma Aracı'ndaki bir alan adı girişine otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| PROSITE kayıt tanımlayıcısı | PROSITE | PROSITE kayıt aramasına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| MEROPS kayıt tanımlayıcısı | MEROPS | MEROPS kaydına otomatik bağlantı (MEROPS peptidazlara ve inhibitörlerine kapsamlıdır) | Satır | isteğe bağlı |
| SCOP (alan/PDB erişim numarası) | SCOP | Bir PDB erişim numarası veya SCOP alan adı verildiğinde, bir SCOP ve bir SUPFAM sayfasına otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
| SCOP2 geçersiz kılma | SCOP2 | SCOP ve SCOP2 farklı etki alanı isimlendirmesi kullanır. SCOP için bir etki alanı belirtilmişse bu değeri kullanın.
| Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| CATH (alan/PDB erişim numarası) | CATH | Bir CATH etki alanı kimliği veya PDB erişim numarası verildiğinde, CATH'ye (Protein Yapısal Etki Alanlarının Sınıflandırılması) otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
| TCDB tanımlayıcısı | TCDB | Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı'nda bir tanımlayıcı aramasına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| OPM süperaile tanımlayıcısı | OPM ailesi | Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir süperaile kaydına otomatik bağlantılar. | Satır | isteğe bağlı |
| OPM proteini tanımlayıcısı | OPM proteini | Değer tipik olarak bir PDB tanımlayıcısı olacaktır; Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir protein kaydına otomatik bağlantı verir | Satır | isteğe bağlı |
| CAZy aile tanımlayıcısı | CAZy | Karbonhidrat-Aktif enzimler veritabanındaki bir aile tanım sayfasına otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
| CDD uid | CDD | Korunan Etki Alanı Veritabanındaki bir kayda otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
| align | align | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| resim_boyutu | resim_boyutu | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| alt | alt | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| Membranome süperailesi | Membranome süperailesi | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| Membranome ailesi | Membranome ailesi | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| sınıf | sınıf | bilgi kutusu sınıfı
| Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| aşağı | aşağı | dipnotlar | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
| PDB | PDB | PDB örnekleri. Yalnızca şu durumlarda kullanın: görüntü yok, CATH/SCOP örneği yok, InterPro veya PDB araması başarısız. | İçerik | kaldırıldı |