Şablon:Protein ailesi bilgi kutusu/belge

Bu şablon, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlandığı şekliyle bir protein ailesi/alanı için şablondur.

Kullanım

değiştir

Bu şablonu kullanmak için aşağıdaki metni kopyalayın ve maddenizin en üstüne yapıştırın. Mümkün olduğunca çok alanı doldurun, ancak bazı bilgiler eksikse endişelenmeyin.

{{Protein ailesi bilgi kutusu
| sınıf  = <!-- yer kazanmak için: mw-collapsible mw-collapsed -->
| Sembol = 
| Ad = 
| resim = 
| altyazı = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM ailesi = <!-- aslında OPM süper ailesi. SADECE protein ailesi tam bir "süperaile" eşleşmesine sahip olduğunda yazın! -->
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
| Membranome süperailesi = <!-- yukarıdakiyle aynı: yalnızca tam eşleşme olduğunda. -->
| Membranome ailesi =
}}

Örnekler

değiştir

Aşağıdaki doldurulmuş Pfam bilgi kutusu şablonu sağdaki bilgi kutusunu üretir.

Ligand-binding domain (LBD)
RORγ (PDB: 3L0L​)
Tanımlayıcılar
Hormone_recep
PfamPF00104
InterProIPR000536
SMARTSM00430
CATH1lbd
SCOP21lbd / SCOPe / SUPFAM
CDDcd06157
Mevcut protein yapıları:
Pfam  yapılar / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumyapı özeti
{{Protein ailesi bilgi kutusu
| Sembol = Hormone_recep
| sınıf  = collapsible
| Ad = Ligand-binding domain (LBD)
| resim = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR ile ilişkili yetim reseptör gama|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM ailesi =
| OPM proteini =
| CDD = cd06157
}}

TemplateData

değiştir
Bu şablon, Görsel Düzenleyici ve diğer araçları kullanarak oluşturulmuş TemplateData şablonu belgelemesidir; bu şablon için aylık hata raporuna bakın.

Protein ailesi bilgi kutusu için şablon verileri

Bu, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlanan bir protein ailesi/alanı için şablondur.

Şablon parametreleri[Şablon veriyi değiştir]

ParametreAçıklamaTürDurum
SembolSembol

açıklama yok

Satıristeğe bağlı
AdAd

açıklama yok

Satıristeğe bağlı
resimresim

izleme kategorisini bastırmak için gerekli değilse "NONE" olarak doldurun

Dosyaisteğe bağlı
Genişlikgenişlik

Görüntü için genişlik

Dizeisteğe bağlı
Altyazıaltyazı

Resim için altyazı

Dizeisteğe bağlı
InterPro aile tanımlayıcısıInterPro

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
Pfam aile tanımlayıcısıPfam

Pfam aile kaydına otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
Pfam klanı tanımlayıcısıPfam_klanı

Pfam klan kaydına otomatik bağlantılar; bir klan, ilişkili ailelerden oluşan bir gruptur (~üst aile).

Satıristeğe bağlı
Interpro tanımlayıcısıInterpro

Interpro girişine otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
SMART erişim numarasıSMART

Basit Modüler Mimari Araştırma Aracı'ndaki bir alan adı girişine otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
PROSITE kayıt tanımlayıcısıPROSITE

PROSITE kayıt aramasına otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
MEROPS kayıt tanımlayıcısıMEROPS

MEROPS kaydına otomatik bağlantı (MEROPS peptidazlara ve inhibitörlerine kapsamlıdır)

Satıristeğe bağlı
SCOP (alan/PDB erişim numarası)SCOP

Bir PDB erişim numarası veya SCOP alan adı verildiğinde, bir SCOP ve bir SUPFAM sayfasına otomatik bağlantı verir.

Satıristeğe bağlı
SCOP2 geçersiz kılmaSCOP2

SCOP ve SCOP2 farklı etki alanı isimlendirmesi kullanır. SCOP için bir etki alanı belirtilmişse bu değeri kullanın.

Örnek
8029676
Bilinmiyoristeğe bağlı
CATH (alan/PDB erişim numarası)CATH

Bir CATH etki alanı kimliği veya PDB erişim numarası verildiğinde, CATH'ye (Protein Yapısal Etki Alanlarının Sınıflandırılması) otomatik bağlantı verir.

Satıristeğe bağlı
TCDB tanımlayıcısıTCDB

Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı'nda bir tanımlayıcı aramasına otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
OPM süperaile tanımlayıcısıOPM ailesi

Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir süperaile kaydına otomatik bağlantılar.

Satıristeğe bağlı
OPM proteini tanımlayıcısıOPM proteini

Değer tipik olarak bir PDB tanımlayıcısı olacaktır; Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir protein kaydına otomatik bağlantı verir

Satıristeğe bağlı
CAZy aile tanımlayıcısıCAZy

Karbonhidrat-Aktif enzimler veritabanındaki bir aile tanım sayfasına otomatik bağlantı verir.

Satıristeğe bağlı
CDD uidCDD

Korunan Etki Alanı Veritabanındaki bir kayda otomatik bağlantı

Satıristeğe bağlı
alignalign

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
resim_boyuturesim_boyutu

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
altalt

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
Membranome süperailesiMembranome süperailesi

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
Membranome ailesiMembranome ailesi

açıklama yok

Bilinmiyoristeğe bağlı
sınıfsınıf

bilgi kutusu sınıfı

Örnek
mw-collapsible mw-collapsed
Bilinmiyoristeğe bağlı
aşağıaşağı

dipnotlar

Bilinmiyoristeğe bağlı
PDBPDB

PDB örnekleri. Yalnızca şu durumlarda kullanın: görüntü yok, CATH/SCOP örneği yok, InterPro veya PDB araması başarısız.

İçerikkaldırıldı