Türkiye Şampiyonası'na katılacak takımların belirleneceği Federasyon Kupası'na İstanbul'dan iştirak edecek takımları tespit etmek üzere 2 Nisan 1949'da yapılan ön eleme karşılaşmalarında Fenerbahçe, İstanbul Birinci Ligi'nde yer alan rakibi Vefa'yı farklı yenmeyi başardı. Bir diğer Birinci Lig takımı olan Modaspor ise İkinci Lig ikincisi İstanbulspor'u 60-27 mağlup etti. Bu sonuçlarla Fenerbahçe ve Modaspor Federasyon Kupası'na katılmaya hak kazandılar.
Federasyon Kupası İstanbul'da düzenlendi ve takımlar iki gruba ayrıldılar. A grubunda İstanbul'dan Fenerbahçe, Eskişehir'den Havagücü ve Edirne'den Meriçspor; B grubunda ise İstanbul'dan Modaspor ve Kurtuluş, Ankara'dan Hava Harp Okulu yer aldılar. A grubunda Fenerbahçe ve Havagücü Meriçspor'u farklı yendiler. Grup birincisini belirleyecek karşılaşmada Havagücü Fenerbahçe'yi mağlup ederek finale yükseldi. Diğer grupta ise, Hava Harp Okulu Modaspor'a hükmen, Kurtuluş'a ise 59-22 yenildi. bu grubun birincisini belirleyecek maçta ise Modaspor Kurtuluş'u 37-21 mağlup ederek finale kaldı. 17 Nisan 1949 tarihindeki finalde Modaspor'u 32-22 yenen Havagücü Türkiye Şampiyonası'na katılmaya hak kazandı.[1]
Kadıköy Halkevi Spor Salonu'nda oynanan karşılaşmalarda Eskişehir Havagücü'nü başarıya ulaştıran en önemli oyuncu aslen Fenerbahçeli bir basketbolcu olan ancak o dönemde askerliğini yaptığı için Havagücü forması giyen Aron Habib ile yine Fenerbahçe sempatisiyle bilinen sonraların hava orgenerali Çelikcan Şişmantürk'tü. Habib'in terhis olduktan sonra İsrail'e yerleşmesiyle Fenerbahçe ve Millî takım geleceğin önemli bir yıldızından da mahrum kalmıştı.[2]