Galatasaray Lisesi'nin 100. kuruluş yıldönümü vesilesiyle Ali Sami Yen Stadyumu'nda kuruluan açık hava basketbol sahasında yapılan dörtlü turnuvada Fenerbahçe, Bulgar takımının ardından, ikinci oldu.
Fenerbahçe ilk yarıyı 35-29 önde bitirmesine, son iki dakikaya da 62-58 önde girmesine rağmen rakibine yakalandı ve normal süre 68-68 sonuçlandı. Uzatma da 78-78 sonuçlandınca maç ikinci kez uzadı. İkinci uzatmada rakibine teslim olan Fenerbahçe, bu sezon İTÜ ile yaptığı üç maçı da kaybetmiş oldu.
Genç takım İTÜ'nün ardından İstanbul ikincisi oldu. Bu sonuçla 1-5 Mayıs 1969 tarihlerinde Sakarya’da düzenlenen Türkiye Gençler Basketbol Şampiyonası’na doğrudan katılan takım Türkiye üçüncülüğüne ulaştı.
Mehmet Baturalp tarafından çalıştırılan ve bir sezon önce namağlup İstanbul şampiyonu ve Türkiye ikincisi olan yıldız takım 1968-69 sezonunu bir kez daha İstanbul şampiyonu olarak tamamladı.
18-20 Nisan 1969 tarihlerinde Bolu’da düzenlenen Türkiye Yıldızlar Basketbol Şampiyonası'nda önce Ankara Kolej'i ve Beykoz'u mağlup eden, 20 Nisan 1969 günü ise Karşıyaka’yı 26-23 yenen sarı-lacivertliler tarihlerinde ilk kez yıldız erkekler kategorisinde Türkiye şampiyonluğuna ulaştılar.